С 1941 по 1942 год Валентин Николаевич служил военврачом 3-го ранга и командиром санитарной роты 38-го Краснознаменного стрелкового полка 14-й гвардейской стрелковой дивизии 1-й гвардейской армии.
Зимой 1942 года, в ходе ожесточенных боев, его часть стремительно продвигалась вперед, нанося удары по противнику. Немецкая авиация пыталась прикрыть свои войска, и на передовой скопилось много раненых. Не дожидаясь, пока раненых доставят в тыл, и понимая критичность ситуации, Валентин Николаевич сам выехал на передовую на машине, чтобы оказать помощь бойцам. В этот момент налетели вражеские истребители, и пулеметной очередью он был смертельно ранен.
Согласно боевому донесению и приказу об исключении из списков части, военврач 3-го ранга В.Н. Щипов погиб 24 ноября 1942 года в бою у станицы Боковской Ростовской области. В тот же день вместе с ним погибли еще 8 человек личного состава, включая командиров взводов и заместителей командиров роты.