С первых дней войны, будучи студентом, Илья Моисеевич дежурил в госпиталях Симферополя, куда поступали раненые моряки Черноморского флота. Здесь, на практике, он осваивал методы остановки кровотечений, первичной обработки ран и иммобилизации. Студенты также участвовали в строительстве противотанковых рвов и изготовлении зажигательных приспособлений.
В сентябре 1941 года институт был эвакуирован в Армавир, где медики оказывали помощь защитникам Ростова и Севастополя, а также жителям блокадного Ленинграда. Летом 1942 года, под массированными бомбежками, коллектив пешком ушел из горящего Армавира, эвакуировавшись в Кзыл-Орду (Казахская ССР), где продолжил помогать фронту, участвуя в строительстве Сырдарьинского оросительного канала.
Весной 1944 года, сдав государственные экзамены, Илья Моисеевич был направлен в распоряжение Главного военно-медицинского управления и отправлен на 1-й Украинский фронт ординатором армейского госпиталя в звании старшего лейтенанта медицинской службы. Его служба началась в период наступления под Львовом. Вскоре госпиталь был передислоцирован на Сандомирский плацдарм, где медики разместились в землянках и палатках, работая днем и ночью, без сна и отдыха.
Перед решающими ударами по врагу молодые врачи прошли интенсивное усовершенствование на госпитальной базе во Львове под руководством крупных специалистов. К началу Берлинской операции они уже были квалифицированными военными хирургами. Госпиталь обеспечивал бесперебойную помощь раненым на Берлинском направлении, принимая потоки бойцов вплоть до 9 мая 1945 года и даже после капитуляции Германии, долечивая тех, кто освобождал Чехословакию. Одновременно медики оказывали помощь, в том числе акушерскую, местному населению в зоне оккупации.
Как вспоминал сам Илья Моисеевич: «Армия сражалась, армия училась побеждать. Такая же непрерывная учеба шла в медицинских учреждениях фронта».