В период Великой Отечественной войны с 1942 по 1945 годы, Михаил Федорович Софронов занимал врачебные должности: начальника лечебного отдела УПЭП 170 1-й гвардейской армии Юго-Западного фронта и старшего инспектора-невролога УПЭП 179 1-го Украинского фронта. С 1945 по 1948 годы он был начальником военных госпиталей 2957 в Бадене и 737 в Вене (Австрия).
Выдержка из характеристики в наградном листе к ордену Отечественной войны II степени от 9 апреля 1945 года красноречиво говорит о профессиональных и личных качествах Михаила Федоровича: «Подполковник медицинской службы Софронов Михаил Федорович – волевой, преданный своему делу офицер и отличный организатор санитарного обеспечения операций в системе ПЭП 179. В период последней наступательной операции фронта подполковник Софронов, как начальник оперативной группы ПЭП 179, проделал большую организационную работу по лечебно-эвакуационному обеспечению раненых и больных. В напряженный момент работы госпиталей в Заверце, когда поток раненых был велик, подполковник не растерялся. Он умело расставил кадры, организовал приемно-сортировочные отделения, обеспечил санитарную обработку раненых и оказание хирургической помощи на должном уровне.
Кроме того, подполковником Софроновым была проведена большая работа по оборудованию безномерных санлетучек и эвакуации раненых в условиях напряженной ситуации на железных дорогах. Параллельно с организационной работой он также наладил неврологическую помощь в госпиталях ПЭП 179».