В июне 1941 г. вновь был призван в армию, с сентября того же года — на фронтах Великой Отечественной войны. «Участвуя в наступательных боях за город Рыльск тов. Зубков со своим взводом организовал вынос раненых с поля боя через реку Сейм. Здесь его взвод вынес с поля боя 175 человек тяжело раненых с их оружием, лично он вынес 28 тяжело раненых и вынес их через реку Сейм, рискуя при этом каждый раз жизнью. Здесь тов. Зубков был ранен, но не оставил своего поста до конца боя. Участвуя в наступательных боях в районе реки Днепр, тов. Зубков проявил исключительный героизм, идя на смерть ради спасения жизни многих бойцов и командиров, 5 суток без нормального отдыха обеспечивая вынос тяжело раненых, переправляя с их оружием через реку Днепр. При непрекращающимся минометно-артиллерийским огнем он переправил через реку Днепр и эвакуировал со своим взводом 192 тяжело раненых бойцов и командиров. Лично в этих боях он вынес 31 тяжело раненых бойцов и командиров с их оружием. За исключительный героизм, за мужество и отвагу, проявленную тов. Зубковым для спасения воинов Красной армии за вынос им лично за время пребывания в полку 175 тяжело раненых под обстрелом противника с поля боя с их оружием вполне достоин звания Герой Советского Союза 1 » Во время контратаки немцев 13 марта 1945 г. был убит осколком сна - ряда. Тело героя А.В. Зубкова было похоронено с воинскими почестями в городе Бельске-Бяла (Польша) на военном кладбище.