Владимир Станиславович Шапкин родился 19 мая 1918 года в городе Новосибирске. В 1937 году он поступил в Новосибирский Медицинский институт, а в 1941— был призван в качестве заурядврача в ряды Красной Армии с пятого курса медицинского института. В должности старшего врача авиационного полка Владимир Станиславович участвовал в Великой Отечественной войне. После демобилизации в 1946 году он восстановился на пятый курс НГМИ, который с отличием окончил в 1947 г.