После окончания Киевского медицинского института в 1922 г., работал в г. Нежин
Черниговской области зав. сельской больницей. С 1925 г. - клинический ординатор
факультетской хирургической клиники Харьковского мединститута, затем, с 1928 г.
заведующий Каракульской районной больницей в Узбекистане. В1931 г. вернулся в
Харьков и стал работать ассистентом хирургической клиники Харьковского
мединститута, врачом-хирургом в 1-ой городской больницы имени В.И. Ленина. В 1937 г. Владимир Васильевич защитил кандидатскую диссертацию "Перитониты без перфорации". С 1940 г. работал ассистентом кафедры общей хирургии Харьковского
стоматологического института.
С 1945 г. - ассистент по курсу военно-полевой хирургии, доцент факультетской хирургической клиники Харьковского мединститута. В 1953 г. - доцент кафедры общей хирургии. В 1954 г. защитил докторскую диссертацию "Первичный рак желчного пузыря и внепеченочных желчных протоков". С 1957 по 1970 гг. заведующий кафедрой общей хирургии Читинского медицинского института.
Его научные исследования в Забайкалье связаны с проблемой краевой патологии - эндемическим зобом: распространенность среди взрослого и детского населения, содержание йода, марганца, фтора и роданидов в питьевой воде эндемических очагов, меры профилактики зоба, послеоперационные осложнения, тиреотоксический криз и др. Является организатором первой научно-практической конференции хирургов Забайкальской железной дороги в 1962 г., на которой обсуждались проблемы эндемического зоба. Был редактором сборника научных работ "Зоб в Забайкалье", выпушенном в 1963 г. Автор 53 научных работ, учебно-методических материалов.

17 июля 1941 г. Владимир Васильевич Попов был призван в ряды РККА. Служил хирургом в военном госпитале 376, затем был начальником эвакогоспиталя 1773 под осажденным Ленинградом на Волховском фронте, ведущим хирургом эвакогоспиталя 1926, старшим хирургом-инспектором полевого эвакопункта 102 4 Украинского фронта, начальником хирургического отделения гарнизонного госпиталя. Закончил путь военного хирурга под Прагой. Демобилизован в 1945 г. в звании майора медицинской службы.

Награжден орденами Отечественной войны II степени, Красной Звезды, "Знак Почета", Чехословацким офицерским крестом, медалями "За оборону Ленинграда", "За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941 – 1945 г." и другими.